Na orbite je neznámou silnou civilizáciou napadnutá loď Normandy. V jej troskách sa pohybuje váš hrdina, ale pri nehode príde o kyslík a gravitácia neďalekej planéty si jej pomaly nehybné telo stále viac približuje. Po nejakom čase nájdu jej mŕtve telo a oživia pomocou projektu Lazarus, samotným Cerebrom opäť vrátia medzi ľudí. Len jej úplné zotavenie musí náhle prísť o niečo skôr, než bol plánovaný termín, pretože miesto znovuzrodenia je pod útokom.